第二次審査を通過した作品は、キッズデザイン賞として顕彰します。
そのうち、６つの部門それぞれで最も優れたものに最優秀賞（大臣賞）が授与されます。
最優秀賞
キッズセーフティ賞（経済産業大臣賞）
子どもを対象にした安全・安心に寄与する製品・施設・サービス・研究などの中で最も優れたもの
ユニバーサルセーフティ賞（経済産業大臣賞）
大人を含む一般生活者全般を対象にした安全・安心に寄与する製品・施設・サービス・研究などの中で、子ども視点の反映が最も優れたもの
フューチャーアクション賞（経済産業大臣賞）
子どもの健全な育成、五感や感性の発達に寄与するサービス、ワークショップ、CSR、研究など活動、ソフトを中心としたもののなかで最も優れたもの
フューチャープロダクツ賞（経済産業大臣賞）
子どもの健全な育成、五感や感性の発達に寄与する製品、施設などのハードを中心としたものの中で最も優れたもの
ソーシャルキッズサポート賞（少子化対策担当大臣賞）
妊婦やその周辺の人、乳幼児や子育て支援に寄与するサービス、ワークショップ、CSR、研究など活動、ソフトを中心としたものの中で最も優れたもの
ソーシャルキッズプロダクツ賞（少子化対策担当大臣賞）
妊婦やその周辺の人、乳幼児や子育て支援に寄与する製品、施設などのハードを中心としたものの中で最も優れたもの
優秀賞
最優秀賞以外にも各部門において特筆すべき作品については、優秀賞（キッズデザイン協議会会長賞）として顕彰します。
審査委員長特別賞
その他優れた作品について、審査委員長特別賞として顕彰する予定です。2009年度第3回キッズデザイン賞では以下の審査委員長特別賞を設けました。
・ 青少年育成企業賞
・ 青少年育成自治体賞
・ 青少年育成研究機関賞
